Après traitement primaire par décantation et traitement des eaux résiduelles par la biomasse, les boues primaires et secondaires doivent être traitées afin de les stabiliser et de les éliminer. En effet, les boues primaires sont en décomposition et malodorantes, les boues secondaires s'accroissent de boues en excès après chaque passage en bassin d'aération.

Le traitement des boues représente 30% de l'investissement dans la construction d'une station d'épuration. Ce traitement doit impérativement réduire le volume; les boues en sortie de clarificateur ont une faible teneur en matière sèche (0,5%) , et les rendre non odorantes en réduisant ou stoppant l'évolution biologique des matières organiques résiduelles fermentescibles.

Différents procédés permettent d'arriver à un état plastique des boues. On " égoutte " d'abord les boues en épaississeur pour ensuite les " stabiliser " biologiquement par différents procédés choisis en STEP en fonction des charges polluantes et économiques et enfin les " réduire " afin de faciliter la manutention, le transport.

Une station produit approximativement 80g de matières par E.H. et par jour. Ainsi une unité de traitement de 100 000 E.H. fournit quotidiennement 8 tonnes de boues déshydratées à 40%.